Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARL4AP40617 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms