Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX2P40425 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX2P40425 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX2P40425 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX2P40425 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX2P40425 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX2P40425 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX2P40425 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX2P40425 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX2P40425 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX2P40425 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX2P40425 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX2P40425 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX2P40425 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX2P40425 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX2P40425 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX2P40425 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX2P40425 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX2P40425 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX2P40425 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX2P40425 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX2P40425 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX2P40425 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX2P40425 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PBX2P40425 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PBX2P40425 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PBX2P40425 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PBX2P40425 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX2P40425 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX2P40425 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX2P40425 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX2P40425 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX2P40425 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX2P40425 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX2P40425 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX2P40425 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX2P40425 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX2P40425 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX2P40425 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX2P40425 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX2P40425 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX2P40425 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX2P40425 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX2P40425 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX2P40425 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX2P40425 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX2P40425 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX2P40425 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX2P40425 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX2P40425 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX2P40425 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX2P40425 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX2P40425 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX2P40425 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX2P40425 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX2P40425 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX2P40425 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX2P40425 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX2P40425 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX2P40425 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX2P40425 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX2P40425 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX2P40425 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX2P40425 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX2P40425 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX2P40425 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX2P40425 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX2P40425 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX2P40425 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX2P40425 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX2P40425 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX2P40425 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX2P40425 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX2P40425 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX2P40425 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX2P40425 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX2P40425 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX2P40425 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX2P40425 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX2P40425 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX2P40425 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX2P40425 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX2P40425 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX2P40425 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX2P40425 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX2P40425 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX2P40425 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX2P40425 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX2P40425 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX2P40425 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX2P40425 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX2P40425 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX2P40425 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX2P40425 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX2P40425 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX2P40425 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX2P40425 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX2P40425 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX2P40425 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX2P40425 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms