Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SREBF1P36956 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SREBF1P36956 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms