Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP5C1P36542 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5C1P36542 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5C1P36542 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms