Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NF2P35240 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NF2P35240 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NF2P35240 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NF2P35240 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NF2P35240 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NF2P35240 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NF2P35240 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NF2P35240 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NF2P35240 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NF2P35240 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NF2P35240 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NF2P35240 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NF2P35240 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NF2P35240 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NF2P35240 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NF2P35240 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NF2P35240 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NF2P35240 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NF2P35240 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NF2P35240 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NF2P35240 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NF2P35240 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NF2P35240 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NF2P35240 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NF2P35240 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NF2P35240 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NF2P35240 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NF2P35240 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NF2P35240 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NF2P35240 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NF2P35240 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NF2P35240 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NF2P35240 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NF2P35240 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NF2P35240 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NF2P35240 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NF2P35240 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NF2P35240 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NF2P35240 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NF2P35240 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NF2P35240 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NF2P35240 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NF2P35240 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NF2P35240 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NF2P35240 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NF2P35240 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NF2P35240 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NF2P35240 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NF2P35240 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NF2P35240 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NF2P35240 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NF2P35240 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NF2P35240 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NF2P35240 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NF2P35240 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NF2P35240 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NF2P35240 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NF2P35240 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NF2P35240 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NF2P35240 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NF2P35240 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NF2P35240 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NF2P35240 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NF2P35240 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NF2P35240 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NF2P35240 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NF2P35240 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NF2P35240 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NF2P35240 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NF2P35240 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NF2P35240 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NF2P35240 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NF2P35240 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NF2P35240 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NF2P35240 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NF2P35240 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NF2P35240 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NF2P35240 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NF2P35240 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NF2P35240 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NF2P35240 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NF2P35240 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NF2P35240 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NF2P35240 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NF2P35240 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NF2P35240 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NF2P35240 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NF2P35240 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NF2P35240 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms