Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF2RBP32927 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms