Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA9P31269 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA9P31269 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA9P31269 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms