Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS1P29558 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBMS1P29558 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBMS1P29558 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms