Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCD3P28288 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD3P28288 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms