Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMB5P28074 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMB5P28074 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB5P28074 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms