Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA1P25391 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMA1P25391 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms