Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM3P25205 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM3P25205 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM3P25205 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM3P25205 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM3P25205 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM3P25205 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM3P25205 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM3P25205 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM3P25205 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM3P25205 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM3P25205 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM3P25205 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM3P25205 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM3P25205 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM3P25205 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM3P25205 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM3P25205 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM3P25205 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM3P25205 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM3P25205 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM3P25205 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM3P25205 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM3P25205 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM3P25205 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM3P25205 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM3P25205 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM3P25205 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM3P25205 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM3P25205 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM3P25205 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM3P25205 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM3P25205 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM3P25205 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM3P25205 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM3P25205 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM3P25205 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM3P25205 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM3P25205 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM3P25205 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCM3P25205 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM3P25205 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM3P25205 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3P25205 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3P25205 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3P25205 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3P25205 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3P25205 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3P25205 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3P25205 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM3P25205 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3P25205 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3P25205 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3P25205 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3P25205 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM3P25205 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM3P25205 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms