Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR1P25024 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR1P25024 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR1P25024 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR1P25024 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCR1P25024 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR1P25024 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR1P25024 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR1P25024 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR1P25024 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR1P25024 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR1P25024 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR1P25024 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR1P25024 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR1P25024 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR1P25024 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR1P25024 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR1P25024 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR1P25024 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR1P25024 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR1P25024 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR1P25024 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR1P25024 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR1P25024 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR1P25024 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR1P25024 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR1P25024 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXCR1P25024 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR1P25024 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR1P25024 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR1P25024 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR1P25024 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR1P25024 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR1P25024 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR1P25024 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR1P25024 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR1P25024 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR1P25024 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR1P25024 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR1P25024 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR1P25024 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR1P25024 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR1P25024 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR1P25024 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR1P25024 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR1P25024 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CXCR1P25024 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CXCR1P25024 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR1P25024 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms