Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP100P23497 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SP100P23497 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP100P23497 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP100P23497 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP100P23497 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP100P23497 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP100P23497 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP100P23497 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP100P23497 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP100P23497 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP100P23497 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP100P23497 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP100P23497 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP100P23497 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP100P23497 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP100P23497 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SP100P23497 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SP100P23497 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SP100P23497 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SP100P23497 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP100P23497 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP100P23497 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP100P23497 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP100P23497 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP100P23497 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP100P23497 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP100P23497 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP100P23497 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP100P23497 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP100P23497 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP100P23497 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP100P23497 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP100P23497 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP100P23497 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP100P23497 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP100P23497 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP100P23497 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP100P23497 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP100P23497 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP100P23497 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP100P23497 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP100P23497 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SP100P23497 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP100P23497 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP100P23497 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP100P23497 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP100P23497 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP100P23497 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP100P23497 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP100P23497 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP100P23497 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SP100P23497 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP100P23497 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP100P23497 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP100P23497 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP100P23497 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SP100P23497 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP100P23497 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP100P23497 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP100P23497 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP100P23497 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP100P23497 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP100P23497 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP100P23497 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP100P23497 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SP100P23497 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP100P23497 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP100P23497 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP100P23497 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP100P23497 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP100P23497 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP100P23497 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP100P23497 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP100P23497 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP100P23497 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP100P23497 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms