Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPREP23469 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPREP23469 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPREP23469 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPREP23469 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPREP23469 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPREP23469 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPREP23469 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPREP23469 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPREP23469 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPREP23469 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPREP23469 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPREP23469 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPREP23469 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPREP23469 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPREP23469 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPREP23469 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPREP23469 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPREP23469 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPREP23469 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPREP23469 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPREP23469 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPREP23469 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPREP23469 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPREP23469 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPREP23469 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPREP23469 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPREP23469 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPREP23469 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPREP23469 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPREP23469 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPREP23469 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPREP23469 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPREP23469 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPREP23469 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPREP23469 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPREP23469 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPREP23469 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPREP23469 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPREP23469 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPREP23469 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPREP23469 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPREP23469 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPREP23469 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPREP23469 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPREP23469 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPREP23469 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPREP23469 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPREP23469 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPREP23469 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPREP23469 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPREP23469 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPREP23469 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPREP23469 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPREP23469 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPREP23469 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPREP23469 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPREP23469 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPREP23469 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPREP23469 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPREP23469 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPREP23469 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPREP23469 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPREP23469 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPREP23469 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPREP23469 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPREP23469 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPREP23469 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPREP23469 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPREP23469 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPREP23469 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPREP23469 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPREP23469 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPREP23469 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPREP23469 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPREP23469 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPREP23469 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPREP23469 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPREP23469 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPREP23469 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPREP23469 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPREP23469 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPREP23469 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPREP23469 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPREP23469 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPREP23469 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPREP23469 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPREP23469 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPREP23469 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms