Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR3P22607 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR3P22607 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms