Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH3P22223 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH3P22223 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH3P22223 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH3P22223 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH3P22223 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH3P22223 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH3P22223 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH3P22223 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH3P22223 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH3P22223 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH3P22223 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH3P22223 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH3P22223 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH3P22223 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH3P22223 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH3P22223 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH3P22223 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH3P22223 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH3P22223 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH3P22223 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH3P22223 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH3P22223 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH3P22223 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH3P22223 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH3P22223 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH3P22223 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH3P22223 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH3P22223 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH3P22223 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH3P22223 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH3P22223 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH3P22223 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH3P22223 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH3P22223 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH3P22223 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH3P22223 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH3P22223 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH3P22223 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH3P22223 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH3P22223 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH3P22223 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH3P22223 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms