Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD247P20963 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD247P20963 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD247P20963 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD247P20963 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD247P20963 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD247P20963 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD247P20963 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD247P20963 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD247P20963 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD247P20963 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD247P20963 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD247P20963 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD247P20963 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD247P20963 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD247P20963 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD247P20963 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD247P20963 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD247P20963 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD247P20963 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD247P20963 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD247P20963 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD247P20963 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD247P20963 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CD247P20963 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CD247P20963 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD247P20963 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD247P20963 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD247P20963 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD247P20963 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD247P20963 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD247P20963 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD247P20963 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD247P20963 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD247P20963 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD247P20963 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD247P20963 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD247P20963 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD247P20963 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD247P20963 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD247P20963 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD247P20963 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD247P20963 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD247P20963 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD247P20963 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD247P20963 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD247P20963 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD247P20963 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD247P20963 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD247P20963 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD247P20963 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD247P20963 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD247P20963 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD247P20963 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD247P20963 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD247P20963 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD247P20963 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD247P20963 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CD247P20963 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD247P20963 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD247P20963 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD247P20963 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD247P20963 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD247P20963 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD247P20963 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD247P20963 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD247P20963 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD247P20963 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CD247P20963 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD247P20963 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD247P20963 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD247P20963 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD247P20963 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD247P20963 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD247P20963 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD247P20963 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD247P20963 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD247P20963 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD247P20963 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD247P20963 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms