Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB1P20618 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms