Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC1P18887 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC1P18887 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms