Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARF4P18085 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARF4P18085 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARF4P18085 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARF4P18085 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARF4P18085 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARF4P18085 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARF4P18085 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARF4P18085 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARF4P18085 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARF4P18085 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARF4P18085 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARF4P18085 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARF4P18085 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARF4P18085 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF4P18085 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF4P18085 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF4P18085 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF4P18085 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF4P18085 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF4P18085 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF4P18085 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF4P18085 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF4P18085 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF4P18085 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF4P18085 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF4P18085 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF4P18085 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF4P18085 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF4P18085 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF4P18085 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF4P18085 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARF4P18085 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ARF4P18085 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARF4P18085 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARF4P18085 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARF4P18085 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF4P18085 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF4P18085 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF4P18085 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF4P18085 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF4P18085 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF4P18085 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF4P18085 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF4P18085 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF4P18085 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARF4P18085 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARF4P18085 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARF4P18085 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARF4P18085 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARF4P18085 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF4P18085 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF4P18085 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF4P18085 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF4P18085 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF4P18085 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF4P18085 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF4P18085 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF4P18085 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF4P18085 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF4P18085 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF4P18085 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF4P18085 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF4P18085 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF4P18085 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF4P18085 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF4P18085 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF4P18085 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARF4P18085 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARF4P18085 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARF4P18085 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARF4P18085 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARF4P18085 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARF4P18085 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARF4P18085 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARF4P18085 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARF4P18085 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARF4P18085 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARF4P18085 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARF4P18085 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARF4P18085 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARF4P18085 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF4P18085 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARF4P18085 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARF4P18085 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARF4P18085 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARF4P18085 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARF4P18085 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF4P18085 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF4P18085 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.5 ms