Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYN1P17600 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYN1P17600 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYN1P17600 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYN1P17600 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYN1P17600 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYN1P17600 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYN1P17600 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYN1P17600 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYN1P17600 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYN1P17600 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYN1P17600 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYN1P17600 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYN1P17600 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYN1P17600 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYN1P17600 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYN1P17600 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYN1P17600 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYN1P17600 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYN1P17600 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYN1P17600 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYN1P17600 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYN1P17600 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYN1P17600 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYN1P17600 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYN1P17600 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYN1P17600 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYN1P17600 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYN1P17600 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYN1P17600 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYN1P17600 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYN1P17600 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYN1P17600 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYN1P17600 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYN1P17600 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYN1P17600 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYN1P17600 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYN1P17600 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYN1P17600 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYN1P17600 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYN1P17600 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYN1P17600 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYN1P17600 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYN1P17600 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYN1P17600 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYN1P17600 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYN1P17600 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYN1P17600 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYN1P17600 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYN1P17600 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYN1P17600 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYN1P17600 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYN1P17600 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYN1P17600 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYN1P17600 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYN1P17600 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYN1P17600 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYN1P17600 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYN1P17600 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYN1P17600 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYN1P17600 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYN1P17600 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYN1P17600 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYN1P17600 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYN1P17600 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYN1P17600 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYN1P17600 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYN1P17600 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYN1P17600 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYN1P17600 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYN1P17600 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYN1P17600 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYN1P17600 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYN1P17600 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYN1P17600 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYN1P17600 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYN1P17600 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYN1P17600 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYN1P17600 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYN1P17600 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYN1P17600 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYN1P17600 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYN1P17600 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYN1P17600 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYN1P17600 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYN1P17600 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYN1P17600 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYN1P17600 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYN1P17600 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms