Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB8P17481 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB8P17481 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms