Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1P17174 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1P17174 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1P17174 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOT1P17174 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1P17174 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1P17174 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1P17174 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1P17174 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1P17174 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1P17174 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1P17174 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOT1P17174 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOT1P17174 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1P17174 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1P17174 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1P17174 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1P17174 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1P17174 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1P17174 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOT1P17174 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1P17174 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1P17174 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1P17174 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1P17174 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1P17174 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1P17174 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1P17174 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1P17174 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOT1P17174 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1P17174 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1P17174 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1P17174 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1P17174 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1P17174 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1P17174 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1P17174 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOT1P17174 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOT1P17174 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1P17174 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1P17174 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1P17174 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1P17174 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1P17174 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1P17174 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1P17174 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1P17174 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1P17174 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOT1P17174 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1P17174 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1P17174 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1P17174 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1P17174 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1P17174 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1P17174 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1P17174 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1P17174 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOT1P17174 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOT1P17174 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOT1P17174 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOT1P17174 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOT1P17174 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOT1P17174 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOT1P17174 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOT1P17174 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOT1P17174 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOT1P17174 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOT1P17174 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1P17174 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1P17174 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1P17174 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1P17174 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1P17174 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1P17174 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOT1P17174 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOT1P17174 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOT1P17174 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOT1P17174 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOT1P17174 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOT1P17174 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1P17174 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1P17174 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1P17174 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1P17174 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1P17174 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1P17174 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1P17174 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOT1P17174 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1P17174 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1P17174 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms