Protein–RNA interactions for Protein: P16473

TSHR, Thyrotropin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHRP16473 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSHRP16473 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSHRP16473 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSHRP16473 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSHRP16473 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSHRP16473 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSHRP16473 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSHRP16473 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSHRP16473 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSHRP16473 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSHRP16473 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSHRP16473 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSHRP16473 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSHRP16473 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSHRP16473 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSHRP16473 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSHRP16473 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSHRP16473 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSHRP16473 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSHRP16473 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSHRP16473 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSHRP16473 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSHRP16473 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSHRP16473 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSHRP16473 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSHRP16473 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSHRP16473 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSHRP16473 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSHRP16473 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSHRP16473 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSHRP16473 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSHRP16473 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSHRP16473 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSHRP16473 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSHRP16473 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSHRP16473 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSHRP16473 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSHRP16473 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSHRP16473 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSHRP16473 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSHRP16473 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSHRP16473 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSHRP16473 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSHRP16473 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSHRP16473 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSHRP16473 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSHRP16473 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSHRP16473 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSHRP16473 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSHRP16473 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSHRP16473 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSHRP16473 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSHRP16473 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSHRP16473 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSHRP16473 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSHRP16473 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSHRP16473 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSHRP16473 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSHRP16473 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSHRP16473 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSHRP16473 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSHRP16473 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSHRP16473 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSHRP16473 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSHRP16473 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSHRP16473 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSHRP16473 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSHRP16473 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSHRP16473 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSHRP16473 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSHRP16473 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSHRP16473 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSHRP16473 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSHRP16473 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSHRP16473 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSHRP16473 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSHRP16473 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSHRP16473 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSHRP16473 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSHRP16473 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSHRP16473 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSHRP16473 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSHRP16473 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSHRP16473 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSHRP16473 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSHRP16473 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSHRP16473 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSHRP16473 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSHRP16473 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSHRP16473 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSHRP16473 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSHRP16473 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSHRP16473 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSHRP16473 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSHRP16473 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSHRP16473 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSHRP16473 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSHRP16473 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSHRP16473 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSHRP16473 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms