Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF2P15336 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF2P15336 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF2P15336 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF2P15336 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF2P15336 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF2P15336 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF2P15336 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF2P15336 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF2P15336 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF2P15336 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF2P15336 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF2P15336 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF2P15336 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF2P15336 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF2P15336 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF2P15336 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF2P15336 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF2P15336 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF2P15336 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF2P15336 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF2P15336 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF2P15336 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF2P15336 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF2P15336 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF2P15336 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF2P15336 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF2P15336 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF2P15336 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF2P15336 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF2P15336 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF2P15336 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF2P15336 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF2P15336 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF2P15336 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF2P15336 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF2P15336 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF2P15336 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF2P15336 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF2P15336 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF2P15336 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF2P15336 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF2P15336 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF2P15336 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF2P15336 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF2P15336 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF2P15336 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF2P15336 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF2P15336 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF2P15336 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF2P15336 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF2P15336 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF2P15336 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF2P15336 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF2P15336 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF2P15336 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF2P15336 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF2P15336 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF2P15336 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF2P15336 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF2P15336 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF2P15336 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF2P15336 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF2P15336 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF2P15336 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF2P15336 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF2P15336 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF2P15336 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF2P15336 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF2P15336 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF2P15336 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF2P15336 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF2P15336 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF2P15336 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF2P15336 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms