Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LCP1P13796 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCP1P13796 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCP1P13796 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCP1P13796 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCP1P13796 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCP1P13796 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCP1P13796 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCP1P13796 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LCP1P13796 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCP1P13796 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCP1P13796 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCP1P13796 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCP1P13796 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCP1P13796 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCP1P13796 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCP1P13796 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCP1P13796 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCP1P13796 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCP1P13796 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCP1P13796 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCP1P13796 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCP1P13796 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCP1P13796 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCP1P13796 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCP1P13796 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCP1P13796 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCP1P13796 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCP1P13796 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCP1P13796 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCP1P13796 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCP1P13796 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCP1P13796 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCP1P13796 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCP1P13796 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCP1P13796 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCP1P13796 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCP1P13796 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCP1P13796 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCP1P13796 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCP1P13796 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCP1P13796 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCP1P13796 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCP1P13796 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCP1P13796 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCP1P13796 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCP1P13796 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCP1P13796 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCP1P13796 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCP1P13796 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCP1P13796 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCP1P13796 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCP1P13796 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCP1P13796 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LCP1P13796 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCP1P13796 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCP1P13796 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCP1P13796 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCP1P13796 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCP1P13796 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCP1P13796 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LCP1P13796 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LCP1P13796 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LCP1P13796 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCP1P13796 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCP1P13796 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCP1P13796 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCP1P13796 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCP1P13796 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LCP1P13796 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCP1P13796 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCP1P13796 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCP1P13796 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LCP1P13796 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCP1P13796 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LCP1P13796 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCP1P13796 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LCP1P13796 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCP1P13796 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCP1P13796 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCP1P13796 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCP1P13796 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCP1P13796 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCP1P13796 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCP1P13796 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCP1P13796 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCP1P13796 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCP1P13796 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCP1P13796 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCP1P13796 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms