Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC5P13010 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
XRCC5P13010 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
XRCC5P13010 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XRCC5P13010 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms