Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYL1P12980 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYL1P12980 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYL1P12980 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYL1P12980 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYL1P12980 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYL1P12980 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYL1P12980 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYL1P12980 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYL1P12980 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYL1P12980 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYL1P12980 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LYL1P12980 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYL1P12980 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYL1P12980 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LYL1P12980 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYL1P12980 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYL1P12980 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYL1P12980 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYL1P12980 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYL1P12980 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYL1P12980 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYL1P12980 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYL1P12980 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYL1P12980 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYL1P12980 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYL1P12980 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYL1P12980 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYL1P12980 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYL1P12980 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYL1P12980 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYL1P12980 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYL1P12980 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYL1P12980 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYL1P12980 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYL1P12980 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYL1P12980 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LYL1P12980 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LYL1P12980 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LYL1P12980 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LYL1P12980 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LYL1P12980 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYL1P12980 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYL1P12980 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYL1P12980 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYL1P12980 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYL1P12980 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYL1P12980 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYL1P12980 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYL1P12980 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms