Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRFP11831 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRFP11831 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRFP11831 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRFP11831 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRFP11831 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRFP11831 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRFP11831 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRFP11831 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRFP11831 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRFP11831 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRFP11831 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRFP11831 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRFP11831 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRFP11831 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRFP11831 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRFP11831 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRFP11831 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRFP11831 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRFP11831 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRFP11831 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRFP11831 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRFP11831 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRFP11831 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRFP11831 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRFP11831 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRFP11831 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRFP11831 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRFP11831 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRFP11831 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRFP11831 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRFP11831 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRFP11831 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRFP11831 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRFP11831 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRFP11831 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRFP11831 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRFP11831 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRFP11831 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRFP11831 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRFP11831 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRFP11831 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRFP11831 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRFP11831 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRFP11831 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRFP11831 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRFP11831 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRFP11831 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRFP11831 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRFP11831 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRFP11831 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRFP11831 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRFP11831 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRFP11831 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRFP11831 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRFP11831 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRFP11831 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRFP11831 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRFP11831 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRFP11831 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRFP11831 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRFP11831 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRFP11831 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRFP11831 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRFP11831 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRFP11831 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRFP11831 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRFP11831 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRFP11831 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRFP11831 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRFP11831 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRFP11831 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRFP11831 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRFP11831 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRFP11831 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRFP11831 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRFP11831 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRFP11831 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRFP11831 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRFP11831 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRFP11831 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRFP11831 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRFP11831 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRFP11831 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRFP11831 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRFP11831 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRFP11831 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRFP11831 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRFP11831 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRFP11831 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms