Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LAMC1P11047 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMC1P11047 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
LAMC1P11047 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC1P11047 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms