Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP10827 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP10827 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP10827 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP10827 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP10827 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP10827 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THRAP10827 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP10827 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP10827 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP10827 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP10827 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP10827 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP10827 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP10827 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP10827 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP10827 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP10827 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP10827 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP10827 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP10827 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP10827 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP10827 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP10827 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP10827 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP10827 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP10827 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP10827 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP10827 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP10827 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP10827 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP10827 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP10827 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP10827 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP10827 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP10827 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP10827 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP10827 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP10827 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP10827 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP10827 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP10827 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THRAP10827 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THRAP10827 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
THRAP10827 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THRAP10827 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THRAP10827 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THRAP10827 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THRAP10827 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THRAP10827 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
THRAP10827 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THRAP10827 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THRAP10827 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THRAP10827 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THRAP10827 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THRAP10827 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THRAP10827 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THRAP10827 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THRAP10827 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THRAP10827 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THRAP10827 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRAP10827 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRAP10827 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRAP10827 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRAP10827 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
THRAP10827 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRAP10827 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRAP10827 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRAP10827 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRAP10827 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRAP10827 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRAP10827 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRAP10827 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRAP10827 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRAP10827 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRAP10827 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRAP10827 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRAP10827 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRAP10827 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRAP10827 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRAP10827 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRAP10827 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRAP10827 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
THRAP10827 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRAP10827 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRAP10827 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRAP10827 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRAP10827 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRAP10827 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRAP10827 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRAP10827 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRAP10827 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRAP10827 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRAP10827 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRAP10827 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRAP10827 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRAP10827 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRAP10827 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THRAP10827 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THRAP10827 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms