Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PF4V1P10720 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PF4V1P10720 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PF4V1P10720 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PF4V1P10720 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PF4V1P10720 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PF4V1P10720 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PF4V1P10720 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms