Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-30-5P0DP03 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGHV3-30-5P0DP03 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms