Protein–RNA interactions for Protein: P0CB48

UBTFL6, Putative upstream-binding factor 1-like protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL6P0CB48 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBTFL6P0CB48 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBTFL6P0CB48 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms