Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP1P09874 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP1P09874 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP1P09874 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP1P09874 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP1P09874 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP1P09874 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP1P09874 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP1P09874 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP1P09874 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP1P09874 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP1P09874 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP1P09874 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP1P09874 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP1P09874 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP1P09874 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP1P09874 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP1P09874 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP1P09874 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP1P09874 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP1P09874 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP1P09874 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP1P09874 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP1P09874 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP1P09874 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP1P09874 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP1P09874 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP1P09874 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP1P09874 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP1P09874 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP1P09874 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP1P09874 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP1P09874 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP1P09874 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP1P09874 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP1P09874 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP1P09874 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP1P09874 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP1P09874 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP1P09874 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP1P09874 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP1P09874 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP1P09874 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP1P09874 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP1P09874 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP1P09874 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP1P09874 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP1P09874 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP1P09874 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP1P09874 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP1P09874 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP1P09874 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP1P09874 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP1P09874 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP1P09874 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP1P09874 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP1P09874 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP1P09874 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP1P09874 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP1P09874 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP1P09874 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP1P09874 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP1P09874 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP1P09874 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP1P09874 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP1P09874 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP1P09874 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP1P09874 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP1P09874 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP1P09874 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP1P09874 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP1P09874 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP1P09874 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP1P09874 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP1P09874 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP1P09874 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARP1P09874 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms