Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP1P09455 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP1P09455 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP1P09455 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP1P09455 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP1P09455 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP1P09455 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP1P09455 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP1P09455 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP1P09455 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP1P09455 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP1P09455 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP1P09455 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP1P09455 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP1P09455 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP1P09455 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP1P09455 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP1P09455 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP1P09455 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP1P09455 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP1P09455 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP1P09455 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP1P09455 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP1P09455 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP1P09455 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP1P09455 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP1P09455 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP1P09455 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP1P09455 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP1P09455 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP1P09455 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP1P09455 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP1P09455 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP1P09455 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP1P09455 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP1P09455 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP1P09455 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP1P09455 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RBP1P09455 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP1P09455 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP1P09455 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP1P09455 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP1P09455 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms