Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT19P08727 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT19P08727 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT19P08727 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT19P08727 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT19P08727 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT19P08727 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT19P08727 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT19P08727 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT19P08727 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT19P08727 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT19P08727 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT19P08727 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT19P08727 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT19P08727 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT19P08727 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT19P08727 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT19P08727 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT19P08727 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT19P08727 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT19P08727 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT19P08727 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT19P08727 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT19P08727 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT19P08727 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT19P08727 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT19P08727 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT19P08727 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT19P08727 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT19P08727 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT19P08727 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT19P08727 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT19P08727 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT19P08727 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT19P08727 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT19P08727 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT19P08727 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT19P08727 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT19P08727 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT19P08727 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT19P08727 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT19P08727 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT19P08727 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT19P08727 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT19P08727 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT19P08727 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT19P08727 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT19P08727 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT19P08727 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT19P08727 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT19P08727 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT19P08727 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT19P08727 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT19P08727 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT19P08727 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT19P08727 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT19P08727 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT19P08727 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT19P08727 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT19P08727 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT19P08727 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT19P08727 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT19P08727 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT19P08727 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT19P08727 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT19P08727 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT19P08727 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT19P08727 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT19P08727 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT19P08727 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT19P08727 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT19P08727 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT19P08727 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT19P08727 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT19P08727 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT19P08727 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT19P08727 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT19P08727 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT19P08727 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT19P08727 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms