Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKMP08237 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKMP08237 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKMP08237 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKMP08237 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKMP08237 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKMP08237 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKMP08237 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKMP08237 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKMP08237 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKMP08237 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKMP08237 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKMP08237 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKMP08237 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKMP08237 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFKMP08237 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFKMP08237 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFKMP08237 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFKMP08237 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFKMP08237 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFKMP08237 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PFKMP08237 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFKMP08237 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PFKMP08237 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKMP08237 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKMP08237 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKMP08237 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFKMP08237 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFKMP08237 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFKMP08237 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFKMP08237 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFKMP08237 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKMP08237 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKMP08237 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKMP08237 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKMP08237 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKMP08237 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKMP08237 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKMP08237 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKMP08237 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKMP08237 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKMP08237 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKMP08237 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKMP08237 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKMP08237 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKMP08237 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKMP08237 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKMP08237 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKMP08237 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKMP08237 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKMP08237 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKMP08237 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKMP08237 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKMP08237 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKMP08237 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKMP08237 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKMP08237 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKMP08237 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKMP08237 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKMP08237 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKMP08237 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKMP08237 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKMP08237 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKMP08237 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKMP08237 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKMP08237 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKMP08237 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKMP08237 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKMP08237 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKMP08237 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKMP08237 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKMP08237 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKMP08237 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKMP08237 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKMP08237 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKMP08237 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKMP08237 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKMP08237 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKMP08237 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFKMP08237 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKMP08237 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKMP08237 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKMP08237 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKMP08237 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKMP08237 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKMP08237 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKMP08237 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms