Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP1P08047 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP1P08047 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SP1P08047 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP1P08047 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP1P08047 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SP1P08047 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP1P08047 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP1P08047 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SP1P08047 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP1P08047 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP1P08047 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP1P08047 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP1P08047 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP1P08047 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP1P08047 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP1P08047 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP1P08047 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SP1P08047 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP1P08047 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP1P08047 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP1P08047 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SP1P08047 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SP1P08047 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SP1P08047 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SP1P08047 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SP1P08047 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SP1P08047 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SP1P08047 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SP1P08047 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SP1P08047 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SP1P08047 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SP1P08047 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SP1P08047 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SP1P08047 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SP1P08047 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SP1P08047 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SP1P08047 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP1P08047 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP1P08047 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP1P08047 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP1P08047 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP1P08047 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SP1P08047 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP1P08047 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP1P08047 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP1P08047 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP1P08047 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SP1P08047 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP1P08047 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP1P08047 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP1P08047 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP1P08047 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP1P08047 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP1P08047 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP1P08047 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP1P08047 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP1P08047 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP1P08047 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP1P08047 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP1P08047 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP1P08047 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP1P08047 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP1P08047 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP1P08047 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP1P08047 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP1P08047 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP1P08047 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP1P08047 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP1P08047 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP1P08047 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP1P08047 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP1P08047 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP1P08047 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP1P08047 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SP1P08047 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP1P08047 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms