Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSLP07711 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSLP07711 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSLP07711 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSLP07711 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSLP07711 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSLP07711 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSLP07711 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSLP07711 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSLP07711 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSLP07711 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSLP07711 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSLP07711 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSLP07711 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSLP07711 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSLP07711 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSLP07711 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSLP07711 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSLP07711 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSLP07711 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSLP07711 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSLP07711 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSLP07711 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSLP07711 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSLP07711 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSLP07711 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSLP07711 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSLP07711 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSLP07711 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSLP07711 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSLP07711 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSLP07711 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSLP07711 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSLP07711 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSLP07711 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSLP07711 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSLP07711 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSLP07711 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSLP07711 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSLP07711 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSLP07711 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSLP07711 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSLP07711 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSLP07711 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSLP07711 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSLP07711 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSLP07711 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSLP07711 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSLP07711 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSLP07711 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSLP07711 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSLP07711 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSLP07711 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSLP07711 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSLP07711 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSLP07711 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTSLP07711 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSLP07711 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSLP07711 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSLP07711 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSLP07711 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSLP07711 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSLP07711 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSLP07711 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms