Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPLP06858 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPLP06858 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPLP06858 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPLP06858 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPLP06858 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LPLP06858 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPLP06858 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPLP06858 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPLP06858 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPLP06858 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPLP06858 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LPLP06858 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPLP06858 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPLP06858 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPLP06858 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LPLP06858 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LPLP06858 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPLP06858 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPLP06858 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPLP06858 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPLP06858 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPLP06858 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPLP06858 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPLP06858 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPLP06858 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPLP06858 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPLP06858 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPLP06858 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPLP06858 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPLP06858 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPLP06858 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPLP06858 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPLP06858 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPLP06858 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPLP06858 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPLP06858 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPLP06858 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPLP06858 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPLP06858 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPLP06858 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPLP06858 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPLP06858 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPLP06858 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPLP06858 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPLP06858 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPLP06858 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPLP06858 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms