Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGF1P05230 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGF1P05230 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGF1P05230 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGF1P05230 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGF1P05230 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGF1P05230 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGF1P05230 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGF1P05230 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGF1P05230 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGF1P05230 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGF1P05230 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGF1P05230 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FGF1P05230 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGF1P05230 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGF1P05230 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGF1P05230 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGF1P05230 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGF1P05230 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGF1P05230 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGF1P05230 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGF1P05230 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGF1P05230 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGF1P05230 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FGF1P05230 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGF1P05230 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGF1P05230 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGF1P05230 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGF1P05230 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGF1P05230 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGF1P05230 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGF1P05230 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FGF1P05230 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGF1P05230 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGF1P05230 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGF1P05230 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGF1P05230 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FGF1P05230 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGF1P05230 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGF1P05230 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGF1P05230 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGF1P05230 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGF1P05230 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGF1P05230 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGF1P05230 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGF1P05230 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGF1P05230 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGF1P05230 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGF1P05230 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGF1P05230 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGF1P05230 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGF1P05230 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGF1P05230 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGF1P05230 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGF1P05230 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGF1P05230 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGF1P05230 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGF1P05230 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGF1P05230 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGF1P05230 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGF1P05230 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGF1P05230 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGF1P05230 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGF1P05230 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGF1P05230 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGF1P05230 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGF1P05230 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGF1P05230 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGF1P05230 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGF1P05230 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGF1P05230 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGF1P05230 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGF1P05230 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGF1P05230 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGF1P05230 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms