Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCGP05129 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms