Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNA4P05014 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFNA4P05014 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms