Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1QAP02745 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QAP02745 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QAP02745 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QAP02745 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QAP02745 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QAP02745 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QAP02745 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QAP02745 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QAP02745 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QAP02745 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QAP02745 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QAP02745 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QAP02745 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QAP02745 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QAP02745 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QAP02745 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QAP02745 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QAP02745 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QAP02745 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QAP02745 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QAP02745 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QAP02745 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QAP02745 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QAP02745 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QAP02745 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QAP02745 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QAP02745 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QAP02745 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QAP02745 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QAP02745 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QAP02745 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QAP02745 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QAP02745 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QAP02745 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QAP02745 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QAP02745 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QAP02745 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QAP02745 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QAP02745 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QAP02745 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QAP02745 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QAP02745 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QAP02745 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QAP02745 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QAP02745 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QAP02745 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QAP02745 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QAP02745 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QAP02745 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QAP02745 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QAP02745 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QAP02745 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QAP02745 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QAP02745 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QAP02745 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QAP02745 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QAP02745 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QAP02745 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QAP02745 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QAP02745 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QAP02745 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QAP02745 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QAP02745 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QAP02745 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QAP02745 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1QAP02745 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QAP02745 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QAP02745 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QAP02745 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QAP02745 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QAP02745 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QAP02745 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QAP02745 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QAP02745 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QAP02745 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QAP02745 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QAP02745 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms