Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOEP02649 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOEP02649 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOEP02649 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOEP02649 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOEP02649 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOEP02649 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOEP02649 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOEP02649 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOEP02649 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOEP02649 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOEP02649 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOEP02649 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOEP02649 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOEP02649 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOEP02649 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOEP02649 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOEP02649 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOEP02649 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOEP02649 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOEP02649 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOEP02649 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOEP02649 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOEP02649 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOEP02649 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOEP02649 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOEP02649 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOEP02649 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOEP02649 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOEP02649 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOEP02649 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOEP02649 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOEP02649 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOEP02649 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APOEP02649 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOEP02649 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOEP02649 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOEP02649 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOEP02649 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOEP02649 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOEP02649 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOEP02649 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOEP02649 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOEP02649 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOEP02649 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOEP02649 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOEP02649 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOEP02649 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOEP02649 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOEP02649 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOEP02649 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOEP02649 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOEP02649 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOEP02649 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOEP02649 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOEP02649 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOEP02649 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOEP02649 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOEP02649 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOEP02649 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOEP02649 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOEP02649 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOEP02649 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOEP02649 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOEP02649 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOEP02649 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOEP02649 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOEP02649 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOEP02649 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APOEP02649 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOEP02649 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOEP02649 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOEP02649 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOEP02649 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOEP02649 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOEP02649 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOEP02649 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOEP02649 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOEP02649 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOEP02649 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOEP02649 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOEP02649 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOEP02649 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOEP02649 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOEP02649 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOEP02649 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOEP02649 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOEP02649 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOEP02649 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOEP02649 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOEP02649 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOEP02649 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOEP02649 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOEP02649 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOEP02649 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOEP02649 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOEP02649 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOEP02649 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOEP02649 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOEP02649 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms