Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL2A1P02458 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
COL2A1P02458 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms