Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTAP01040 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTAP01040 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTAP01040 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTAP01040 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTAP01040 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTAP01040 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTAP01040 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTAP01040 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTAP01040 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTAP01040 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTAP01040 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTAP01040 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTAP01040 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTAP01040 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTAP01040 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTAP01040 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTAP01040 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTAP01040 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTAP01040 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTAP01040 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTAP01040 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTAP01040 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTAP01040 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTAP01040 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTAP01040 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTAP01040 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTAP01040 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTAP01040 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTAP01040 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTAP01040 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTAP01040 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTAP01040 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTAP01040 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTAP01040 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTAP01040 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTAP01040 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSTAP01040 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTAP01040 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTAP01040 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTAP01040 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTAP01040 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTAP01040 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTAP01040 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTAP01040 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSTAP01040 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSTAP01040 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTAP01040 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTAP01040 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTAP01040 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTAP01040 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTAP01040 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTAP01040 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSTAP01040 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms