Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
F9P00740 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
F9P00740 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
F9P00740 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
F9P00740 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
F9P00740 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
F9P00740 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
F9P00740 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
F9P00740 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F9P00740 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F9P00740 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F9P00740 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F9P00740 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F9P00740 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F9P00740 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
F9P00740 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F9P00740 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F9P00740 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F9P00740 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F9P00740 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F9P00740 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F9P00740 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F9P00740 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F9P00740 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F9P00740 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F9P00740 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P00740 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P00740 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P00740 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P00740 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P00740 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P00740 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P00740 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P00740 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P00740 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P00740 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P00740 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
F9P00740 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F9P00740 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
F9P00740 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F9P00740 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F9P00740 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F9P00740 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F9P00740 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F9P00740 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F9P00740 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
F9P00740 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F9P00740 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F9P00740 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
F9P00740 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F9P00740 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
F9P00740 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F9P00740 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F9P00740 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F9P00740 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
F9P00740 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
F9P00740 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
F9P00740 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
F9P00740 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F9P00740 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P00740 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P00740 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P00740 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P00740 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P00740 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P00740 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P00740 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P00740 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P00740 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P00740 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F9P00740 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F9P00740 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F9P00740 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
F9P00740 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F9P00740 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F9P00740 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F9P00740 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F9P00740 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F9P00740 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P00740 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P00740 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P00740 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P00740 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P00740 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P00740 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P00740 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P00740 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms